L’hybridation in situ par fluorescence (FISH) est l’une des nombreuses techniques utilisées pour rechercher l’ADN de vos cellules, en recherchant la présence ou l’absence de gènes spécifiques ou de portions de gènes.
De nombreux types de cancer différents sont associés à des anomalies génétiques connues. Et par génétique, on ne parle pas seulement d’hérédité. Au cours d’une vie, les cellules peuvent faire des erreurs lorsqu’elles se divisent et se développent. Les mutations de l’ADN qui sont associées au cancer peuvent s’accumuler dans ces cellules.
Comment cela fonctionne-t-il ?
La FISH est une technique qui utilise des sondes fluorescentes pour détecter des gènes spécifiques ou des parties de gènes (séquences d’ADN). Le personnel de laboratoire des centres médicaux et les oncologues utilisent la FISH pour aider à évaluer les patients qui pourraient avoir un cancer, et parfois pour surveiller un patient qui a déjà été diagnostiqué avec un cancer et traité.
La FISH peut être réalisée à l’aide de différents types d’échantillons selon le lieu et le type de cancer suspecté : Cellules tumorales obtenues à partir du sang périphérique, d’une biopsie de la moelle osseuse ou d’une biopsie des ganglions lymphatiques, et tissu fixé au formol et enrobé de paraffine (il s’agit d’un échantillon de tissu qui est traité en laboratoire et enrobé dans un type de cire, ce qui le rend plus rigide, de sorte qu’il peut être découpé en fines sections et monté pour être observé au microscope).
Signification des lettres
Le « H » de FISH fait référence à l’hybridation. Dans l’hybridation moléculaire, une séquence d’ADN ou d’ARN marquée est utilisée comme sonde – visualisez une brique Lego rouge, si vous voulez. La sonde est utilisée pour trouver une brique Lego homologue, ou une séquence d’ADN, dans un échantillon biologique.
L’ADN de votre échantillon est comme des piles de briques Lego, et la plupart des briques de ces piles ne correspondront pas à notre sonde rouge. Et toutes vos briques sont soigneusement organisées en 23 paires de piles de briques – chaque pile est plus ou moins une de vos paires de chromosomes homologues. Contrairement aux briques Lego, notre sonde Lego rouge est comme un aimant puissant et trouve sa correspondance sans avoir à trier les piles.
Le « F » fait référence à la fluorescence. Notre sonde rouge peut se perdre dans les piles de briques, c’est pourquoi elle est marquée avec un colorant fluorescent coloré pour qu’elle brille. Lorsqu’elle trouve sa correspondance parmi les 23 piles appariées, une étiquette fluorescente révèle son emplacement. Vous pouvez donc maintenant voir comment les chercheurs et les cliniciens pourraient utiliser FISH pour aider à identifier où (quel tas ou quel chromosome) se trouve un gène particulier pour un individu donné.
Le « I » et le « S » représentent l’expression » in situ« . Cela fait référence au fait que notre brique Lego rouge cherche sa correspondance dans l’échantillon que vous avez donné.
Le poisson et les cancers spécifiques du sang
Le FISH et d’autres procédures d’hybridation in situ sont utilisés pour diagnostiquer diverses anomalies chromosomiques – modifications du matériel génétique, changements dans les chromosomes, notamment
- Suppression : une partie d’un chromosome a disparu
- Translocation : une partie d’un chromosome se détache et se colle sur un autre chromosome
- Inversion : une partie d’un chromosome se détache et se réinsère, mais dans l’ordre inverse
- Duplication : une partie d’un chromosome est présente en trop grand nombre dans la cellule
Chaque type de cancer peut avoir son propre ensemble de modifications chromosomiques et de sondes pertinentes. FISH permet non seulement d’identifier les modifications génétiques initiales dans un processus pathologique comme le cancer, mais il peut également être utilisé pour surveiller la réponse à la thérapie et la rémission de la maladie.
Les modifications génétiques détectées par FISH offrent parfois des informations supplémentaires sur le comportement probable du cancer d’un individu, sur la base de ce qui a été observé dans le passé chez des personnes atteintes du même type de cancer et de modifications génétiques similaires. Parfois, le FISH est utilisé après que le diagnostic a déjà été posé, pour glaner des informations supplémentaires qui pourraient aider à prédire l’issue ou le meilleur traitement d’un patient.
FISH peut identifier des anomalies chromosomiques dans les leucémies, y compris dans la leucémie lymphoïde chronique (LLC). Pour la leucémie lymphocytaire chronique/le lymphome lymphocytaire de petite taille, FISH permet aux patients de connaître leur catégorie de pronostic : bon, intermédiaire ou mauvais. Pour la leucémie lymphoblastique aiguë (LLA), la génétique des cellules leucémiques peut vous renseigner sur le niveau de risque de cancer et vous aider à orienter les décisions thérapeutiques.
Les panels FISH sont également disponibles pour les lymphomes, les myélomes multiples, les troubles prolifératifs des plasmocytes et le syndrome myélodysplasique. Dans le cas du lymphome des cellules du manteau, par exemple, il existe une translocation que FISH peut détecter, appelée GH/CCND1 t (11;14), qui est fréquemment associée à ce lymphome.
Pourquoi la FISH ?
Un des avantages de la FISH est qu’elle n’a pas besoin d’être effectuée sur des cellules qui se divisent activement. Les tests cytogénétiques prennent généralement environ trois semaines, car les cellules cancéreuses doivent se développer dans des boîtes de laboratoire pendant environ deux semaines avant de pouvoir être testées. En revanche, les résultats du test FISH sont généralement disponibles en quelques jours.
Sources des articles (certains en anglais)
- Institut national de recherche sur le génome humain. Fiche d’information sur l’hybridation in situ en fluorescence. Mise à jour le 9 juillet 2015.
- Novello S, Barlesi F, Califano R, et al. Metastatic non-small-cell lung cancer : Guide de pratique clinique de l’ESMO pour le diagnostic, le traitement et le suivi. Ann Oncol. 2016;27(suppl 5):v1-v27. doi:10.1093/annonc/mdw326
- U.S. National Library of Medicine, Genetics Home Reference. Les changements dans la structure des chromosomes peuvent-ils affecter la santé et le développement? Mis à jour le 21 janvier 2020.
- Gulley ML, Shea TC, Fedoriw Y. Tests génétiques pour évaluer le pronostic et prédire la réponse thérapeutique dans la leucémie myéloïde aiguë. J Mol Diagn. 2010;12(1):3-16. doi:10.2353/jmoldx.2010.090054
- Stevens-Kroef MJ, van den Berg E, Olde Weghuis D. Identification des anomalies chromosomiques pertinentes pour le pronostic dans la leucémie lymphoïde chronique à l’aide du profilage génomique basé sur les puces à ADN. Mol cytogenet. 2014;7(1):3-21. doi:10.1186/1755-8166-7-3
- Centre des sciences de la santé de l’université du Texas à San Antonio, laboratoire de cytogénétique clinique et moléculaire. Panneaux FISH.
- Société américaine du cancer. Tests utilisés sur des échantillons de biopsie et de cytologie pour diagnostiquer le cancer. Mis à jour le 30 juillet 2015.
Lectures complémentaires
- Codes CPT pour les tests cytogénétiques du cancer.