La flore est le terme scientifique désignant un groupe de plantes ou de bactéries, typiquement particulier à une certaine région. Il est souvent comparé au terme « faune », qui est utilisé pour décrire la vie animale d’une même région. Dans le domaine de la santé et de la médecine, la flore est le terme utilisé pour décrire les microorganismes qui existent sur ou dans le corps humain, comme la flore intestinale ou la flore cutanée. Lorsque l’on parle de la flore dans le contexte du corps humain, le terme fait référence aux bactéries, aux levures et autres champignons.
Vue d’ensemble
La flore intestinale fait référence au monde des micro-organismes, principalement des bactéries, qui peuplent nos intestins. La recherche se concentre de plus en plus sur la compréhension du rôle que joue la flore intestinale en termes de santé humaine. Différents noms sont utilisés pour désigner cette population interne de micro-organismes :
- Bactéries intestinales
- Flore intestinale
- Microbiote
- Microbiome
- Microflore
Il est devenu extrêmement évident que la flore intestinale joue un rôle important à la fois dans notre santé et dans notre vulnérabilité aux maladies.
Développement
Les bébés naissent avec des intestins que l’on croit être complètement ou principalement stériles. En passant par le canal de naissance de leur mère, ils sont exposés aux microorganismes de son vagin, qui est à l’origine de la population du microbiome. Le microbiome est en outre peuplé par l’exposition environnementale et l’ingestion de lait maternel, de lait maternisé et, finalement, de nourriture. Ce sont ces facteurs qui peuplent le microbiome des bébés qui naissent par césarienne et qui ne passent pas par le canal de naissance. La composition de la flore intestinale continue ensuite d’évoluer tout au long de notre vie.
Lieu
Les substances sécrétées par le processus de digestion ont un effet sur l’endroit où les bactéries intestinales prolifèrent. L’acide gastrique, l’acide biliaire et les enzymes pancréatiques empêchent généralement la colonisation des bactéries dans l’estomac ou la partie initiale de l’intestin grêle. (La surcroissance bactérienne de l’intestin grêle est un problème de santé dans lequel un excès de bactéries se trouve dans l’intestin grêle).
Par conséquent, les bactéries intestinales se trouvent dans une certaine mesure dans la dernière partie de l’intestin grêle, mais surtout dans le gros intestin. On estime qu’il existe plus d’un millier de types de microbes dans votre corps. (Une étude réalisée en 2015
indique que ces microbes représentent entre 25 et 54 % de vos selles). Ce monde de microorganismes est séparé de votre corps à l’intérieur par une seule couche de cellules sur votre gros intestin – des cellules appelées cellules épithéliales.
Fonctions
Comme indiqué ci-dessus, la flore intestinale joue un rôle essentiel dans votre santé. Deux des rôles les plus importants ont trait à la protection du système immunitaire et au métabolisme. Pour ces fonctions importantes, il doit y avoir une prépondérance optimale de bactéries « amies ». Examinons chacune de ces fonctions à tour de rôle :
Soutien au système immunitaire
Il semble que les bactéries de notre intestin soutiennent notre système immunitaire de deux manières. La première est que les bactéries utiles assurent une protection directe de la paroi de notre gros intestin, en empêchant les substances qui nous seraient nuisibles d’entrer dans l’intestin. Lorsque ce système est compromis, un état de perméabilité intestinale accrue (syndrome de l’intestin qui fuit) peut être présent. La seconde est que les bactéries intestinales favorables travaillent avec le système immunitaire au niveau de la paroi de nos intestins pour lutter contre les bactéries ou autres substances pathogènes.
Effets métaboliques utiles
Notre flore intestinale joue un rôle important en nous fournissant des vitamines et d’autres nutriments essentiels à notre santé. Le microbiome interagit également avec les glucides qui n’ont pas été digérés dans l’intestin grêle (tels que l’amidon résistant et les FODMAP). Cette interaction fournit d’autres nutriments, encourage la croissance des cellules épithéliales et module le stockage des graisses.
Problèmes de santé associés
Il est maintenant reconnu qu’une composition de la flore intestinale non optimale peut contribuer à des problèmes de santé, tant digestifs que non digestifs. Parmi les problèmes de santé qui, pour l’instant, semblent avoir un lien direct avec un mauvais équilibre de la flore intestinale, un état connu sous le nom de dysbiose, on peut citer
- Maladies atopiques
- Diabète
- Maladies inflammatoires de l’intestin (MII)
- Syndrome du côlon irritable (SCI)
- Obésité
- Syndrome métabolique
Prendre soin de votre flore intestinale
La réduction du stress, la diminution de l’utilisation des antibiotiques et une alimentation équilibrée et nutritive (y compris les aliments considérés comme prébiotiques) sont autant de facteurs susceptibles d’optimiser la flore intestinale. En outre, bien que les avantages soient loin d’être prouvés, les probiotiques peuvent être utiles et ne semblent pas, en général, aggraver la situation. Une procédure connue sous le nom de transplantation de microbiote fécal semble prometteuse dans les cas extrêmes pour améliorer la santé de la flore intestinale.
Sources des articles (certains en anglais)
- Bull MJ, Plummer NT. Partie 1 : Le microbiome de l’intestin humain dans la santé et la maladie. Integr Med (Encinitas). 2014;13(6):17-22.
- Peterson LW, Artis D. Intestinal epithelial cells : regulators of barrier function and immune homeostasis. Nat Rev Immunol. 2014;14(3):141-53. doi:10.1038/nri3608
- Bull MJ, Plummer NT. Partie 2 : Traitements des maladies gastro-intestinales chroniques et de la dysbiose intestinale. Integr Med (Encinitas). 2015;14(1):25-33.
Lectures complémentaires
- Rose C, Parker A, Jefferson B, Cartmell E. The characterization of feces and urine : Une revue de la littérature pour éclairer les technologies de traitement avancées. Crit Rev Environ Sci Technol. 2015;45(17):1827-1879. doi:10.1080/10643389.2014.1000761